GitLab

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Dummy project to test continuous integration and deployment with gitlab-runner, docker and jwilder/nginx-proxy

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RNAseq pipeline for alternative splicing junctions

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Splicing Prediction Pipeline

STARK repository for sources (tools...)

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CAP (Clipping Amplicon Primer) coupe les primers en identifiant l’amplicon le plus probable pour chaque read. Ces séquences synthétiques mimiques éliminées réduit le bruit de séquençage ainsi que les erreurs de calcul de la fréquence allélique

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Test command-line applications through .should files

HOWARD est un outil d'annotation et de priorisation des variants. Il utilise les outils ANNOVAR et SNPEff et leurs bases de donnees associees, tout en acceptant les bases de donnees a facon.

Pour partager des fichiers de config Docker ou conda par ex., permettant de simplifier les installations des outils ?

Projet de Bioinformatique appliqué à la pharmacogénétique

VISION - VCF Viewer and Prioritization [JARVIS module]

Echanges entre utilisateurs de CNVkit et personnes désirant le mettre en place localement

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